目前我国动漫产业发展中还存在着整体发展水平不高、结构和布局不尽合理、高端人才缺乏三大问题。
首先，动漫产品质量不高，缺少有竞争力的品牌和形象。虽然近年来动漫产品的数量有大幅度的提高，但内涵深刻、风格独特、形式新颖且具有市场竞争力的精品力作不多，缺少在国际国内都能立得住、叫得响的动漫品牌形象，动漫产品的质量和动漫原创水平、能力还有待于进一步提高。
其次，动漫产业结构和布局不尽合理，整体发展水平不高。我国现在有上万家动漫企业，但总体上还处在小、散、弱的状况，动漫企业盈利水平偏低，利润率不高，龙头企业比较少，企业的核心竞争力不足。动漫产业结构尚不合理，产业链不完整，漫画、新媒体动漫、动漫衍生品行业相对薄弱，上下游行业之间还未形成良性循环，仍处于各自为战的状态，资源分散，没有形成合力。各地在动漫发展上还存在急功近利、盲目跟风的现象，不考虑自身的特点和优势，造成同质化低水平恶性竞争。
第三，动漫产业高端人才缺乏，特别是缺少创意策划和经营管理方面的专业人才。目前，动漫从业人员和在校生人数不少，但是创意策划和经营管理等高端人才比较匮乏，大专院校的动漫专业有待于加强，以适合于市场的需求，很多优秀的动漫专业学生选择了设计、游戏等其他行业，动漫产业人才流失情况比较显著。高端人才的缺乏制约了动漫产业发展。
